Выхухоль— реликтовый вид, эндемичный территории России.
Её естественный ареал ограничен бассейнами Днепра, Волги, Дона и Урала.
Современный ареал имеет разорванный характер. Водится она также в Казахстане; в Украине, Литве и Белоруссии исключительно редка. В доисторические времена встречалась в Европе вплоть до Британских островов.